我校创办于1965年，80年代初，为了方便各村群众子女就近上学，当时的莲溪镇政府将莲溪中学搬迁至现校址莲溪安江路369号。莲溪中学位于生态环境优美、水乡文化浓郁的莲洲镇北部，是我区最北的一所农村初级中学，生源主要来于莲洲镇莲溪片的10个自然村（红星村、文锋村、新丰村、东安村、上栏村、下栏村、石龙村、莲江村、光明村、东湾村）。 我校2005年被评为区一级学校，现有教学班8个，学生343人、教师31人。其中，中学高级教师1人、中级教师22人、在职研究生学历1人、本科学历21人。中共党员16人（含退休3人）。
在上级领导的关怀和支持下，通过全体教职员工的共同努力，学校树立“文明、好学、团结、开拓”的办学理念，教风学风日渐浓厚，教育教学质量稳步提高。近年来，师生的违法犯罪率为零，多年获得区德育工作先进单位奖和区教学质量进步奖。2009年、2010年我校参加中学生广播体操比赛分别荣获区级团体一等奖；市级团体三等奖。2009年中考成绩:总平均分、合格率均居全区第4位，农村中学首位。后进率控制的效果较理想，居区首位。2010年中考成绩：总平均分、合格率、有效控制后进率在全区13所中学排列前第三名。2011年中考成绩：总平均分348.6，在全区农村初中排行第三；六科后进率控制在6.8%，在全区初中排行第三位。
学校管理规范有序，制度建设日臻完善。2003学年度学校档案综合管理升为省一级单位。2004年、2006年、2009年我校分别被区教育工会授予校务公开先进单位。2008年，我校档案工作管理被区教育局评为先进集体。2010年我校党支部被评为区级先进基层党支部。2009学年度和2010学年度被评为区级德育工作先进单位和教学质量先进单位。仅2010年度，我校教师科研成果奖：省级二等奖、市级二等奖各1人、市三等奖2人、区级奖10人。学生比赛获奖：市级奖1人、区级特等奖、一等奖各2人、二等奖7人、三等奖17人。2011年度，郑开武校长的论文《狠抓养成教育 形成良好校风》、《激发教师的热情 调动教师的积极性》分别获省二等奖和省三等奖；张建国主任的论文《浅析班主任的领导行为》发表于《广东教学》第1605期；周健强主任的论文《宜将旧酒装新瓶——新课标下的初中语文教学新方式》2011年9月25日发表于《读与写》（第8卷第9期）；郑开武校长的论文《养成教育之我见》2011年10月10日发表于《中小学教育》（总第79期）；周丹丹、李嘉欣、何幸怡同学2011年7月参加珠海市首届“初语杯”读书征文活动获市三等奖；周慧怡、何雅婷、周紫莹三位同学征文在2011年3月发表于《中学生报》第1948期；郑开武、曾强辉、张建国、刘观长、肖剑民，李徳宏等老师先后获斗门区先进教育工作者、斗门区先进德育工作者、市、区先进教师、优秀班主任等光荣称号。