云南中医学院创建于1960年， 是全国第二批成立的高等中医药院校，是云南省政府与国家中管局共建的中医药本科院校。学校是一所以中医药学科为主体，医、理、工、管多学科协调发展，以本科教育为主，研究生教育、继续教育、对外教育共同发展的高等中医药本科院校，具有硕士学位授予权和留学生招收资格，是云南省立项建设的博士授权单位。2007年获教育部本科教学工作水平评估“优秀”，2013年、2015年中医学、中药学专业通过教育部认证。
学校本部现有教职工869人，其中,专任教师613人，国家级专家19人，省级专家40人,博士生研究生导师12人，硕士研究生导师448人，具有博士学历专任教师113人。有全日制学生10551人，其中：本科生9633人，研究生858人，留学生60人；成人教育学生9578人。学校拥有两个校区，占地面积763.20亩，其中呈贡校本部730.33亩，白塔校区32.87亩，总建筑面积27.3万㎡。学校有10个二级学院、2个公共课教学部、1个研究院、1个博物馆。有17个国家中医药管理局重点学科、7个省级重点学科、2个省级优势特色学科，2个省级“十二五”立项建设博士学位授权一级学科；4个一级学科硕士学位授权点（涵盖22个二级学科）和4个专业硕士学位授权点；21个本科专业，其中：国家级特色专业2个、综合改革试点专业1个，省级重点、特色专业各5个、综合改革试点专业3个，省级教学质量工程项目153项。
学校有一批省级教学科研平台和校地、校企、校院共建平台，是云南省中医药国际教育基地、国际科技合作基地、云南省中医药产业发展研究院、云南省中医药政策研究中心、云南省民族医药保护与产业发展研究基地、有6个院士专家工作站，4个省级科研平台，1个省级创新团队，2个省级2011协同创新中心，1个省级中医临床研究基地，7个省级高校重点实验室和工程中心，是云南省优势中药材规范化种植工程研究中心主要成员单位。学校和省内外医院、药企合作建立了129个医药学类实践教学基地、其中13所附属医院，药学类合作基地54个。