南京市清水亭学校是一所位于南京市新规划的南部新城——九龙湖综合发展区的中心地带的九年一贯制学校，建于2007年7月，中、小学部分别创建为江苏省示范初中和江苏省实验小学。学校占地面积90亩，总建筑面积29133平方米，其中普通教室60个、办公室64间、报告厅2个，各种功能室、实验室24个;计算机教室4个;艺术教学楼（清雅楼）1幢、容纳2000人同时就餐的师生食堂1幢，学校图书馆藏书6万多册。学校绿地面积24689平方米，绿化面积22552平方米;学校运动场共占地约13000平方米，全塑胶运动场占地11055平方米，其中300米环形塑胶跑道的田径场一个、篮球场7片、排球场2片、门球场3片和塑胶场地联合器械活动区，较好满足师生课内外文体活动需要。学校努力打造数字化校园，配置了36套多媒体教学设备，建设了录播教室，建成全校监控网络和教学音像系统。
学校现有48个教学班（小学34个，初中14个），共有学生2144人（小学1671人，初中473人）;在编教职工170人（小学88人，初中82人）;教师本科学历112人（小学45，初中67），研究生学历5人，在读研究生3人，市优秀青年教师2人（小学2人）、区各类带头人13名（小学6人，初中7人），区骨干教师35名（小学17人，初中18人）;35周岁以下青年教师71人（小学41人，初中30人），退休教师71人。我校积极培养体育教师队伍，现有体育专职教师10人（小学6人、初中4人），其中门球教练员2人，各类各级裁判员7人。学校已成功创建为江苏省示范初中、江苏省实验小学、江苏省优秀家长学校、中国儿基会“让我玩”项目基地学校、江苏省门球运动传统特色学校、南京市园林式学校、江苏省教育学会美术教科研基地、南京市绿色学校、南京市艺术特色普及性学校、南京市优秀家长学校。省市领导-、曹卫星、许慧玲等先后到学校视察指导工作，对学校的发展给予了大力支持。
学校以“清至真，爱若水”为校训，坚持把陶行知教育思想作为办学的重要指导思想。学校将陶研工作与学校管理、师资队伍、班级文化、教科研、高效课堂改革等工作有机地结合起来，深化工作的实效性和开拓性，有力促进了学校教育质量和办学品位的提升。