学校于1985年8月成立并开始招生，历经黄旗堡镇第一中学—黄旗堡中心中学的校名变迁，于2002年9月改用黄旗堡镇初级中学至今。为优化教育资源，让黄旗堡初中教育驶上快速和谐发展的快车道，2009年3月份根据《坊子区关于学校布局调整的意见》精神，在原黄旗堡高级中学校址，将原黄旗堡中学、逄王中学合并成立新坊子区黄旗堡镇初级中学。
黄旗堡初级中学是一所管理规范、办学特色鲜明的全封闭、寄宿制学校。校园占地面积63.5亩，建筑面积21000平方米。学校建有高标准的教学楼、办公楼、公寓楼、实验楼等基础设施，功能用室齐全，办公用机全部宽带联网。现有22个教学班，在校学生1279人。学校师资力量雄厚，专任教师学历达标率100%。75名一线教师中潍坊市教学能手6人，区教学能手27人，市区优秀教师12人，校首届“教学标兵”7人，全国、省、市、区优秀辅导教师28人，市百佳班主任4人，潍坊市科普园丁奖1人，各级优质课获得者40余人。
一年来，在新一届领导班子带领下，全校110名教职员工紧紧围绕“一年树形象，二年争一流，三年创名校”的既定奋斗目标，精诚团结、奋发进取、务实奉献。通过“抓班子、树正气、重评价、常培训、强身体”五条主要措施扎实开展工作，办学质量呈现出强劲的上升势头，各项工作均得到了区教育局领导的一致认可，潍坊市创新教育管理评估中心对学校的办学水平给予了充分肯定。尤其是学校与杜郎口中学联盟后，在“育人为本，德育为先”的办学理念指引下，广大教师认真践行“自主互助学习型课堂”，让“活”、“真”、“实”充实课堂，依靠学生，相信学生，发动学生，解放学生，让学生动起来，让他们敢想，敢说，敢做，培养创新精神，让课堂活起来，教学效果好起来，使学生对社会做出更大贡献。